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Table 1 : Results of the docking of various ligands in the hvUSP hybrid homology model. The score obtained by Gold as well as the total interaction (Einter) energy obtained by Charmm are indicated. Einter comprises the van der Waals energy term (Vdwinter) and the electrostatic energy term (eelinter).
Gold Charmm
ligand score Einter Vdwinter eelinter
9-cis RA 46,7 -54,8 -37,6 -17,2
JH-I acid 42,1 -53,2 -33,4 -19,8
JH-II acid 42,7 -51,5 -29,1 -22,4
JH-III acid 40,2 -53,5 -31,5 -22,1
methoprene acid 44,5 -63,8 -35,3 -28,5
JH-I ester 43,2 -42,2 -41,4 -0,8
JH-II ester 40,6 -31,7 -35,8 4,1
JH-III ester 41,8 -39,2 -38,5 -0,7
methoprene ester 30,6 -41,8 -42,0 0,1
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